Hæmatokritrør kan bruges til at bestemme hæmatokritværdien i blod. Blodet opsamles med hæmatokritrøret for efterfølgende at blive centrifugeret ved høj hastighed, indtil blodlegemerne adskilles fra plasmaen. Hæmatokritværdien kan bruges til diagnosticering, eksempelvis kan hæmatokrittallet være med til at påvise nogle former for anæmi, ligesom et forhøjet hæmatokrittal indikerer en fortykning af blodet, hvilket kan give risiko for blodpropper. Hæmatokritrør kan desuden bruges til at placere en lille bloddråbe på et objektglas, inden der foretages en udstrygning.